يقوم بوظيفة قاضي تحقيق لدى المحكمة العسكرية قاض أو عدة قضاة من رتبة قاضي تحقيق في ملاك القضاء العدلي (أي ما يوازي الدرجة الرابعة فما فوق، وفقاً للتعديلات الاخيرة لقانون القضاء العدلي) أو ضابط أو عدة ضباط من المجازين في الحقوق.

تجدر الملاحظة هنا إلى أن القانون لم يحدّد رتبة الضباط المجازين الذين يمكن تعيينهم وقياساً على المادة الثامنة من هذا القانون، فمن الأنسب ومراعاةً للتراتبية والأقدمية، أن يكون قاضي التحقيق ضابط مجاز في الحقوق أعلى رتبة من رتبة المدعى عليه.

 يبقى أن نشير إلى أن مركز دائرة التحقيق العسكري يكون لدى مركز المحكمة العسكرية الدائمة.
كما تجدر الملاحظة بأنه يوجد لدى المحكمة العسكرية قاضي تحقيق أول تحال اليه الدعاوى من قبل مفوض الحكومة، ويقوم هو بتوزيعها على باقي قضاة التحقيق كما هو الحال بالنسبة للقضاء العدلي.